ხელნაწერთა ეროვნული ცენტრის საცავებში 6000-ზე მეტი უნიკალური დოკუმენტი, რარიტეტული წიგნი და ხელნაწერი ინახება. ზოგიერთი მათგანი მე-5 საუკუნით არის დათარიღებული. ცენტრის არქივში შენახულია ასევე აფხაზური „დედაენა“ და იმ პატრიარქთა ჩანაწერები, რომლებიც სხვადასხვა დროს ხელმძღვანელობდნენ ცხუმ-აფხაზეთის ეპარქიას.